Le conseil de la faculté traite de toutes les questions qui concernent les affaires de la faculté.
Selon les points traités, il siège en formation plénière ou en formation restreinte.
Préalablement à sa saisine, d’autres instances de la faculté sont saisies par le doyen pour un avis consultatif sur des points qui seront à traiter.
Le conseil se réunit au moins quatre fois par an, en particulier pour traiter des questions concernant le budget et les modalités de contrôle des connaissances en formation plénière et, en formation restreinte pour la campagne d’emplois et la révision des effectifs hospitalo-universitaires.